藥學院建院于2006年，現(xiàn)有藥學、中藥學、應用化學、藥物分析、臨床藥學、中藥制藥、化妝品科學與技術7個本科專業(yè)。學院與東莞理工學院積極探索醫(yī)工交叉學科復合型人才培養(yǎng)，培養(yǎng)適應社會發(fā)展需求的新型學科交叉型人才。成功申報了廣東省首批聯(lián)合學士學位聯(lián)合培養(yǎng)項目：“藥學+材料科學與工程”、“藥學+應用化學”（學生畢業(yè)授予理學和工學雙學士學位）。并于2023年首屆招生，實現(xiàn)了“一次錄取，讀兩個大學；學一個專業(yè)，獲兩個學位”的復合型優(yōu)質人才的培養(yǎng)計劃。

學院藥學專業(yè)開辦于2004年，是廣東省本科一流專業(yè)建設點和重點專業(yè)，臨床藥學專業(yè)是廣東省特色專業(yè)。藥學學科是廣東省高水平大學重點建設學科、廣東省優(yōu)勢重點學科、珠江學者設崗學科。有藥學一級學科碩士學位和藥學碩士專業(yè)學位授權資格。臨床藥理學掛靠臨床醫(yī)學專業(yè)招收博士研究生。設藥學、化學、藥物分析、臨床藥學、中藥學五個系和一個實驗教學中心。建設有化學與藥學、藥物制劑與生藥學、中藥學、儀器分析四個實驗教學示范中心（省級），藥物制劑與制劑技術重點實驗室、東莞市中醫(yī)藥防治消化道疑難病證重點實驗室、東莞市海洋創(chuàng)新藥物與生物制品重點實驗室、中藥與新藥研究重點實驗室、東莞市中藥抗炎活性成分篩選與研究重點實驗室五個重點實驗室（市級）；依托學校海洋醫(yī)藥研究院（省級新型研發(fā)機構、部級博士后科研工作站）、廣東天然藥物研究與開發(fā)重點實驗室（省重點實驗室）、學?？萍奸_發(fā)中心（博士后工作站）等平臺開展教學、科研工作。2020年，藥理學與毒理學進入ESI全球排名前1%；2023年，化學學科進入ESI全球排名前1%。

學院建院以來，立足廣東，著眼環(huán)北部灣中心城市（湛江）、粵港澳大灣區(qū)（東莞）區(qū)位特色，輻射華南，面向全國。人才培養(yǎng)以“人民滿意”為宗旨，恪守“立志立德、求真求精”的校訓，踐行“懂藥懂醫(yī)，中西融通，善和有為”的院訓，秉承“艱苦奮斗、自強不息”的廣東醫(yī)精神，弘揚“嚴謹樸實仁愛奉獻”的校風，實施特色發(fā)展核心戰(zhàn)略，培養(yǎng)具備藥學學科基本知識、基本理論和基本技能，具備創(chuàng)新精神、創(chuàng)新意識和實踐能力，能夠從事藥物研發(fā)、生產、流通、管理、質量控制和藥學服務等方面工作的高素質專門人才。

學院有專任教師102人，正高職稱25人、副高職稱48人，副高以上職稱教師占專任教師總人數(shù)70.19%。具有博士學位的教師80人，占專任教師總人數(shù)78.43%。學院有國家杰青和廣東省杰青各1人，“千百十人才培養(yǎng)工程”省級培養(yǎng)對象2人，廣東省“揚帆計劃”高層次人才項目2人，省級教學名師1人，廣東省高等學校優(yōu)秀青年教師5人。近年來，承擔各級課題293項，其中國家自然科學基金31項、省部級、廳局級項目136項。發(fā)表研究論文932篇，其中SCI論文500篇，總影響因子1317.536。申報專利73項，授權19項，轉讓2項。主編參編專著、教材20余部。主持各級教學改革項目20余項。藥理學和有機化學是廣東省一流本科課程。劉建強教授同時入選“終身科學影響力排行榜”和“2020年度全球2%頂尖科學家影響力排行榜”；周志昆教授團隊獲中國發(fā)明協(xié)會發(fā)明創(chuàng)業(yè)獎創(chuàng)新獎二等獎。近三年，2人獲得廣東省本科高校課程思政優(yōu)秀案例二等獎，3人獲得廣東省高校（本科）青年教師教學大賽三等獎，2人獲得廣東省高校（本科）青年教師教學大賽優(yōu)秀獎。

至今已培養(yǎng)本科生16屆計8352人，累計考取研究生669人，在讀學生2473人。本科生在校期間，主持大學生創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)訓練計劃項目796項，其中國家級84項、省級321項、校級439項。大學生創(chuàng)新實驗項目98項。本科生發(fā)表或參與發(fā)表論文75篇，其中SCI 35篇，影響因子109.4；參與專利申報6項，已授權4項；國家及省“挑戰(zhàn)杯”獎項5項等。2022年，本科生參與省生化技能大賽獲一等獎、二等獎各1項，省大學生科技創(chuàng)新培育專項資金立項5項（重點項目1項，一般項目4項）。2023年第十七屆“挑戰(zhàn)杯”廣東大學生課外學術科技作品競賽中，學生獲特等獎一項、三等獎一項。獲評全國大學生暑期實踐百強項目；5支社會實踐隊伍獲批2022年廣東大中專學生志愿者暑期文化科技衛(wèi)生“三下鄉(xiāng)”社會實踐活動省級重點團隊；2023年，學院4個社會實踐團隊獲團省委授牌。

學院與英國哈德斯菲爾德大學等高校有本科生培養(yǎng)合作項目。先后與國內大型醫(yī)藥企業(yè)、大型綜合醫(yī)院、知名研究機構、藥品檢驗所合作建立了教學實習、就業(yè)合作關系。重點向藥品及化妝品研發(fā)、生產、檢驗、流通及臨床藥學等領域培養(yǎng)創(chuàng)新型及實用型人才。近年來畢業(yè)生就業(yè)去向落實率均超過98%，畢業(yè)生覆蓋全省、輻射全國、涉足國外。目前，學院全體教職員工本著開放、務實、創(chuàng)新、高效的人文精神，以“懂藥懂醫(yī)，中西融通，善和有為”為辦學宗旨，不斷深化教學改革，培養(yǎng)出具有人文情懷、專業(yè)素質好、實踐技能強、具備創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)能力、人民滿意的專門人才。