作為推動(dòng)新千年基礎(chǔ)科學(xué)研究的重要戰(zhàn)略步驟和作為知識創(chuàng)新工程中的一個(gè)試點(diǎn)，中國科學(xué)院于1999年11月27日成立了神經(jīng)科學(xué)研究所。神經(jīng)科學(xué)研究所致力于神經(jīng)科學(xué)基礎(chǔ)研究的各個(gè)領(lǐng)域，包括分子、細(xì)胞和發(fā)育神經(jīng)生物學(xué)、系統(tǒng)和認(rèn)知神經(jīng)科學(xué)科學(xué)、以及腦疾病機(jī)理和診治手段研發(fā)。研究所的宗旨是建立一個(gè)現(xiàn)代化研究所的機(jī)制，提供一個(gè)有助于嚴(yán)謹(jǐn)科研工作，高效科研產(chǎn)出，良性科研合作的環(huán)境，實(shí)現(xiàn)以業(yè)績?yōu)闇?zhǔn)的激勵(lì)和資助評估系統(tǒng)，以及為研究生和博士后提供高質(zhì)量的專業(yè)訓(xùn)練。2014年起，神經(jīng)科學(xué)研究所在中國科學(xué)院體制與機(jī)制改革的框架下，成為中國科學(xué)院腦科學(xué)與智能技術(shù)卓越創(chuàng)新中心(簡稱中國科學(xué)院腦智卓越中心)的依托單位。腦智卓越中心是跨學(xué)科、跨院校的組織（見另一網(wǎng)站:www.cebs.ac.cn）,旨在凝聚中國科學(xué)院內(nèi)外的科研實(shí)力，通過團(tuán)隊(duì)合作和學(xué)科交叉融合，解決在腦科學(xué)和類腦智能技術(shù)兩個(gè)前沿領(lǐng)域的重大問題。

神經(jīng)科學(xué)研究所目前擁有50個(gè)研究組，每個(gè)研究組由不超過五名的工作人員與數(shù)目不等的研究生和博士后組成。許多研究組與國內(nèi)外的同行有合作研究，長期合作者被聘為神經(jīng)所的客座研究員。中國科學(xué)院、國家科技部、基金委等對研究所的資助，使研究所研究人員的經(jīng)費(fèi)和儀器設(shè)備已達(dá)到國際前沿機(jī)構(gòu)的水平。由著名神經(jīng)科學(xué)家組成的國際顧問委員會和評審委員會，定期為神經(jīng)所的體制機(jī)制、科研工作提供建議，對提高研究所的整體科研水平起了積極的推動(dòng)作用。

回顧神經(jīng)所20年來的發(fā)展，大致可以分三個(gè)時(shí)期：2000-2005間是“起步期”。在這個(gè)期間的主要目標(biāo)是建立幾個(gè)高水平的實(shí)驗(yàn)室，出一些高質(zhì)量的文章，建立嚴(yán)謹(jǐn)?shù)难芯繂T考評和研究生培養(yǎng)制度。2005-2015的十年可以說是“成長期”；基于起步期所建立的聲譽(yù)，我們能夠大幅度地招聘到一批優(yōu)秀的研究組長，拓展神經(jīng)所的研究領(lǐng)域，尤其是系統(tǒng)和認(rèn)知神經(jīng)科學(xué)和非人靈長類研究領(lǐng)域。我們希望2016年以后的二十年是神經(jīng)所的“突破期”，在中國科學(xué)院腦智卓越中心的框架下，在幾個(gè)神經(jīng)科學(xué)的前沿領(lǐng)域做出國際領(lǐng)先的重大成果，包括繪制靈長類全腦介觀神經(jīng)聯(lián)接圖譜、闡明幾種高級認(rèn)知功能的神經(jīng)環(huán)路工作原理、創(chuàng)建幾種重大腦疾病的獼猴模型和診斷與干預(yù)手段、類腦機(jī)器學(xué)習(xí)的新算法、閉環(huán)腦機(jī)接口的器件和系統(tǒng)等。有些基礎(chǔ)科學(xué)的創(chuàng)新發(fā)現(xiàn)是“可遇不可求”，但是上述的重大突破，是“有求才可遇”。有求的模式需要有明確的目標(biāo)和里程碑，并能聚集多實(shí)驗(yàn)室、多學(xué)科的力量以團(tuán)隊(duì)模式攻關(guān)。神經(jīng)所在2017年底突破了體細(xì)胞克隆猴的生物技術(shù)難題，就是一個(gè)例子。

對大腦的結(jié)構(gòu)和功能的理解是人類認(rèn)識世界、認(rèn)識自我的最終挑戰(zhàn)；神經(jīng)科學(xué)將是21世紀(jì)最活躍的前沿基礎(chǔ)學(xué)科。過去幾十年神經(jīng)科學(xué)研究在歐美發(fā)達(dá)國家發(fā)展迅速，在上海的中國科學(xué)院神經(jīng)科學(xué)研究所為中國神經(jīng)科學(xué)家提供了一個(gè)立足于本土，并與國際同行合作和平等競爭的機(jī)會。神經(jīng)所科研人員和學(xué)生的活力和熱情預(yù)示了中國神經(jīng)科學(xué)的未來是光明的。