繼續(xù)教育學(xué)院是學(xué)校的二級單位，已有60多年的辦學(xué)歷史，現(xiàn)有職工41人，主要承擔(dān)高等學(xué)歷繼續(xù)教育和非學(xué)歷繼續(xù)教育工作。學(xué)院依托昆明醫(yī)科大學(xué)系統(tǒng)雄厚的師資力量，培養(yǎng)了大批實(shí)用型醫(yī)學(xué)人才。學(xué)院被省教育廳評為“云南省成人高等教育優(yōu)良學(xué)校”“云南省高等教育自學(xué)考試先進(jìn)單位”。

學(xué)院始終堅(jiān)持“以質(zhì)量求生存，以質(zhì)量求發(fā)展”的辦學(xué)方針，自上世紀(jì)80年代恢復(fù)招收夜大學(xué)生以來，先后開設(shè)了高中起點(diǎn)專科、?？破瘘c(diǎn)本科、高中起點(diǎn)本科三個層次的成人學(xué)歷教育，涵蓋了臨床醫(yī)學(xué)、護(hù)理學(xué)、口腔醫(yī)學(xué)、預(yù)防醫(yī)學(xué)、康復(fù)治療學(xué)、醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)技術(shù)、醫(yī)學(xué)影像學(xué)、藥學(xué)、眼視光學(xué)、公共事業(yè)管理、醫(yī)學(xué)影像技術(shù)及助產(chǎn)學(xué)等多個專業(yè)。

為滿足我省廣大基層醫(yī)療衛(wèi)生技術(shù)人員就近、就便接受高等教育的需要，學(xué)院自1996年開始建立校外教學(xué)點(diǎn)，先后在全省16個州（市）建立了108個教學(xué)點(diǎn)。

學(xué)院積極開展崗位及職業(yè)技能培訓(xùn)、執(zhí)業(yè)醫(yī)師及執(zhí)業(yè)護(hù)士考前培訓(xùn)、國際交流合作等工作，1988年起被省教育廳遴選為自學(xué)考試主考院校；2006年通過了省教育廳對普通高校成人繼續(xù)教育函授夜大學(xué)的合格評估。學(xué)院目前是云南省鄉(xiāng)村醫(yī)生規(guī)范化培訓(xùn)指導(dǎo)中心、云南省衛(wèi)生監(jiān)督培訓(xùn)基地、云南省校醫(yī)培訓(xùn)基地、紅十字天使計(jì)劃鄉(xiāng)村醫(yī)生培訓(xùn)基地。