井岡山大學(xué)醫(yī)學(xué)部下設(shè)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院、臨床醫(yī)學(xué)院、護(hù)理學(xué)院、中醫(yī)藥學(xué)院4個(gè)學(xué)院。有臨床醫(yī)學(xué)、口腔醫(yī)學(xué)、中醫(yī)學(xué)、預(yù)防醫(yī)學(xué)、藥學(xué)、護(hù)理學(xué)、康復(fù)治療學(xué)7個(gè)本科專(zhuān)業(yè)。2016年臨床醫(yī)學(xué)專(zhuān)業(yè)和中醫(yī)學(xué)專(zhuān)業(yè)均通過(guò)了教育部專(zhuān)業(yè)認(rèn)證，臨床醫(yī)學(xué)專(zhuān)業(yè)認(rèn)證延長(zhǎng)至2025年。中醫(yī)學(xué)專(zhuān)業(yè)、護(hù)理學(xué)專(zhuān)業(yè)為江西省一流本科建設(shè)專(zhuān)業(yè)，中醫(yī)學(xué)、預(yù)防醫(yī)學(xué)專(zhuān)業(yè)為江西省四星級(jí)專(zhuān)業(yè)。臨床醫(yī)學(xué)、藥學(xué)及護(hù)理學(xué)被學(xué)校評(píng)為核心專(zhuān)業(yè)。學(xué)部與同濟(jì)大學(xué)、廈門(mén)大學(xué)及溫州醫(yī)科大學(xué)簽訂了聯(lián)合培養(yǎng)本科生協(xié)議，臨床醫(yī)學(xué)、護(hù)理學(xué)、藥學(xué)及康復(fù)治療學(xué)專(zhuān)業(yè)優(yōu)秀學(xué)生可選拔到同濟(jì)大學(xué)、廈門(mén)大學(xué)、溫州醫(yī)科大學(xué)進(jìn)行聯(lián)合培養(yǎng)。

學(xué)部現(xiàn)有專(zhuān)任教師120人，其中教授13人、副教授36人，具有博士學(xué)位教師25人（另有在讀博士生3人）。專(zhuān)任教師中江西省先進(jìn)工作者1人、江西省“新世紀(jì)百千萬(wàn)人才工程人選”1人、江西省教學(xué)名師1人、“江西省青年科學(xué)家（井岡之星）”培養(yǎng)對(duì)象教師1人、江西省高校中青年骨干教師7人、省模范教師1人、省級(jí)金牌教授1人、省衛(wèi)生系統(tǒng)學(xué)術(shù)和技術(shù)帶頭培養(yǎng)對(duì)象9人、校級(jí)學(xué)術(shù)帶頭人3人、碩士研究生導(dǎo)師21人。

學(xué)部擁有國(guó)家醫(yī)師執(zhí)業(yè)資格考試（臨床類(lèi)別）實(shí)踐技能考試基地、工信部“專(zhuān)精特新”產(chǎn)業(yè)學(xué)院、中國(guó)循證醫(yī)學(xué)教育部網(wǎng)上合作研究中心井岡山大學(xué)分中心、吉安市醫(yī)藥生物技術(shù)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、井岡山大學(xué)臨床醫(yī)學(xué)研究中心、井岡山大學(xué)實(shí)驗(yàn)動(dòng)物中心、吉安市醫(yī)療糾紛爭(zhēng)議尸驗(yàn)中心、井岡山大學(xué)神經(jīng)退行性疾病與衰老研究中心等教學(xué)科研機(jī)構(gòu)。設(shè)有生命科學(xué)館、基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)實(shí)驗(yàn)中心、臨床技能中心、藥學(xué)綜合實(shí)驗(yàn)室、預(yù)防醫(yī)學(xué)綜合實(shí)驗(yàn)室、基礎(chǔ)護(hù)理綜合實(shí)驗(yàn)室、康復(fù)治療學(xué)綜合實(shí)驗(yàn)室、形態(tài)學(xué)虛擬仿真實(shí)驗(yàn)室和中草藥植物園等教學(xué)平臺(tái)。有直屬附屬醫(yī)院1所，非直屬附屬醫(yī)院5所。

學(xué)部有申碩建設(shè)學(xué)科1個(gè)（公共衛(wèi)生），申碩培育學(xué)科2個(gè)（臨床醫(yī)學(xué)和護(hù)理學(xué)），申碩支撐學(xué)科2個(gè)（中醫(yī)學(xué)和藥學(xué)）。近年來(lái), 獲批國(guó)家級(jí)卓越醫(yī)生教育培養(yǎng)計(jì)劃項(xiàng)目3個(gè)（臨床醫(yī)學(xué)和中醫(yī)學(xué)），國(guó)家級(jí)大學(xué)生校外實(shí)踐教育基地建設(shè)項(xiàng)目1個(gè)，省級(jí)教學(xué)團(tuán)隊(duì)1個(gè)，省級(jí)精品資源共享課程及省級(jí)雙語(yǔ)教學(xué)示范課程各1門(mén)，省級(jí)一流課程4門(mén)。獲江西省教學(xué)成果獎(jiǎng)二等獎(jiǎng)1項(xiàng)，江西省科學(xué)技術(shù)獎(jiǎng)三等獎(jiǎng)1項(xiàng)。

學(xué)部扎實(shí)推進(jìn)教育教學(xué)改革和人才培養(yǎng)模式創(chuàng)新，強(qiáng)化臨床實(shí)踐環(huán)節(jié)，不斷提高人才培養(yǎng)質(zhì)量。近年來(lái)，臨床醫(yī)學(xué)、中醫(yī)學(xué)、口腔醫(yī)學(xué)等專(zhuān)業(yè)畢業(yè)生國(guó)家執(zhí)業(yè)醫(yī)師考試通過(guò)率分別高出全國(guó)平均水平8.10%、11.81%和8.90%。在校學(xué)生獲批國(guó)家級(jí)大學(xué)生創(chuàng)新實(shí)驗(yàn)項(xiàng)目26項(xiàng)，省級(jí)大學(xué)生創(chuàng)新實(shí)驗(yàn)項(xiàng)目13項(xiàng)，校級(jí)大學(xué)生創(chuàng)新實(shí)驗(yàn)項(xiàng)目89項(xiàng)；獲得“挑戰(zhàn)杯”國(guó)賽三等獎(jiǎng)2項(xiàng)，省賽一等獎(jiǎng)1項(xiàng)、二等獎(jiǎng)5項(xiàng)、三等獎(jiǎng)7項(xiàng)，校賽一等獎(jiǎng)4項(xiàng)、二等獎(jiǎng)2項(xiàng)和三等獎(jiǎng)1項(xiàng)，優(yōu)秀獎(jiǎng)2項(xiàng)；全國(guó)大學(xué)生基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)創(chuàng)新研究三等獎(jiǎng)4項(xiàng)，在校生發(fā)表論文45篇，其中本科生作為第一作者發(fā)表論文20篇，SCI收錄論文7篇，CSCD期刊論文7篇，北大核心期刊論文2篇，參與編寫(xiě)專(zhuān)著2部，2篇論文被評(píng)為校十佳論文。臨床醫(yī)學(xué)、護(hù)理學(xué)、預(yù)防醫(yī)學(xué)畢業(yè)生參加全國(guó)高等醫(yī)學(xué)院校臨床技能大賽（華東區(qū)）每屆均獲團(tuán)體三等獎(jiǎng)。近5年畢業(yè)生平均就業(yè)率均高于全省平均水平，畢業(yè)生研究生平均錄取率在21%左右。