歷史沿革：中醫(yī)學院前身為中醫(yī)系，隨校創(chuàng)辦于1959年，是安徽中醫(yī)藥大學建校以來開辦最早的系，1997年更名為臨床醫(yī)學一系，2004年更名為中醫(yī)臨床學院，2017年更名為中醫(yī)學院。

辦學層次：學院現(xiàn)有碩士點5個、博士點1個、博士后流動站1個。目前，在校碩、博士研究生160余人。

機構(gòu)設(shè)置：學院現(xiàn)有4系3中心，分別為中醫(yī)基礎(chǔ)系、方藥系、臨床基礎(chǔ)系、醫(yī)史文獻系、中醫(yī)科研中心（含新安醫(yī)學研究中心）、實驗（實訓）教學中心、徽學分中心。新安醫(yī)學教育部重點實驗室、新安醫(yī)學與中醫(yī)藥現(xiàn)代化研究所、新安醫(yī)學研究院、中醫(yī)基礎(chǔ)理論研究所、中醫(yī)醫(yī)史文獻研究所掛靠在學院。

人才隊伍：學院現(xiàn)有教職工69人，其中具有副高以上職稱者31人；具有博士學位者45人；博士生導師6人，碩士生導師23人；青年皖江學者1人，全國中醫(yī)藥院校教學名師1人，省級教學名師6人，省級教壇新秀3人。學院擁有1個國家級教學團隊、4個省級教學團隊、2個省級科技創(chuàng)新團隊和安徽省“115”產(chǎn)業(yè)創(chuàng)新團隊。

科研教研：學院先后承擔包括國家科技支撐、國家“973”、國家自然科學基金在內(nèi)的國家、?。ú浚?、廳級各類科研項目100余項，國家、省、校級教學研究與改革項目50余項；先后獲省級學術(shù)專著獎一等獎1項，自然科學獎二等獎2項、三等獎6項，國家級優(yōu)秀教學成果二等獎2項，省級優(yōu)秀教學成果特等獎1項、一等獎3項、二等獎3項、三等獎6項；主編或參編高等中醫(yī)藥統(tǒng)編、協(xié)編教材和出版學術(shù)專著300多部，發(fā)表學術(shù)論文3200余篇。

學科平臺：學院是安徽省高峰學科建設(shè)單位，擁有國家中醫(yī)藥管理局重點學科2個，安徽省A類重點學科1個，安徽省B類重點學科3個；國家教育部中醫(yī)學專業(yè)綜合改革項目1個，國家教育部高等學校特色專業(yè)1個，國家級精品課程1門，省級教改示范專業(yè)1個，省級基礎(chǔ)課實驗教學示范中心1個，省級精品課程5門，國家一流課程4門；新安醫(yī)學教育部重點實驗室1個。

對外交流：學院專家教授多人次應邀赴美國、新加坡、加拿大等國以及臺灣、香港等地區(qū)進行學術(shù)交流和講座。吸納多批次國外留學生攻讀學士和碩、博士學位，選派多批次本科生赴韓國、瑞典等國留學。

特色優(yōu)勢：學院是安徽省首批“標桿院系”通過驗收單位、安徽省高校“三全育人”綜合改革試點院系，始終秉承“弘揚新安醫(yī)學，培育中醫(yī)人才”的辦學理念，以黨建工作為引領(lǐng)，在人才培養(yǎng)、學科建設(shè)、科學研究、對外交流等方面形成了自己的獨特辦學優(yōu)勢，為支撐學校發(fā)展發(fā)揮了重要支撐作用。（2024年4月更新）