基礎醫(yī)學院發(fā)端于1926年成立于上海的東南醫(yī)科大學（安徽醫(yī)科大學前身）的若干學科，后經(jīng)半個世紀的發(fā)展壯大， 1976年學校整合人體解剖學、藥理學、生物化學等學科（教研室），設立基礎部，2000年6月正式更名為基礎醫(yī)學院。經(jīng)過近百年的發(fā)展，學院已成為集教學、科研和社會服務于一體的基礎醫(yī)學人才培養(yǎng)基地。

學院下設13個教研室(系)、3個實驗教學中心和2個公共科研平臺。建設有2個國家級實驗教學示范中心，1個國家科技資源共享平臺，1個國家臨床重點?？啤?個省級重點學科，4個省級重點實驗室和科技公共服務平臺，以及省級國際科技合作基地、省級工程研究中心各1個?，F(xiàn)有教職工313人，其中專任教師223名，具有博士學位的教師占比81%，正高職稱56人（二級教授6人），副高職稱122人。近年入選全國優(yōu)秀教師1人，安徽省教書育人楷模1人，安徽省最美教師1人，省級高端人才引育行動項目3人，省級教學名師8人，省級教壇新秀12人。2人入選國家級人才項目，55人入選省部級人才項目。獲批省級領軍人才團隊和省115產(chǎn)業(yè)創(chuàng)新團隊各1個，省高校科研創(chuàng)新團隊2個。

學院現(xiàn)有本科招生專業(yè)3個（基礎醫(yī)學與放射醫(yī)學、法醫(yī)學），在校本科生417人。博士學位授權一級學科2個（基礎醫(yī)學、藥學），博士學位授權二級學科10個；碩士學位授權一級學科2個（基礎醫(yī)學、特種醫(yī)學），碩士學位授權二級學科16個（含1個碩士專業(yè)學位類別-藥學），在校博士研究生89人，碩士研究生693人。建有基礎醫(yī)學、藥學博士后科研流動站。

藥理學與毒理學、分子生物學與遺傳學、生物學與生物化學、免疫學、神經(jīng)科學與行為學進入ESI全球排名前1%?；A醫(yī)學獲批安徽省高峰學科。近年來，學院面向醫(yī)學生命科學前沿和人類健康重大需求，以“人獸共患病及突發(fā)傳染病研究、腦科學與人腦類器官研究、腫瘤與免疫性疾病研究、慢性應激與代謝性疾病研究”等優(yōu)勢學科方向為支撐，聚焦重大疾病研究，圍繞拔尖創(chuàng)新醫(yī)學人才培養(yǎng)核心任務，致力于建成區(qū)域領先、國內(nèi)一流、國際知名的學科。

學院始終把人才培養(yǎng)、教育教學、科學研究、社會服務、文化傳承和創(chuàng)新、國際交流與合作貫穿到辦院興院、立德樹人的全過程，努力為實現(xiàn)建設高水平醫(yī)科大學的大擔當、培育百千萬良醫(yī)的大責任和服務人民群眾的大情懷的“安醫(yī)大發(fā)展之夢”貢獻自己的力量與才智！