南通大學圖書館分布在嗇園校區(qū)、啟秀校區(qū)和啟東校區(qū)，館舍總面積6萬平方米，閱覽座位4000余個。館內設有辦公室、文獻建設部、信息咨詢與技術部、數字人文與信息情報中心（與專業(yè)學科建設辦公室合署）、讀者服務部（嗇園本部、啟秀分部、啟東分部）、古籍保護與利用中心、知識產權信息服務部等部門。

圖書館館藏資源豐富，文獻種類齊全，覆蓋面廣，結構合理，其中工業(yè)技術、文學、醫(yī)藥、經濟等類目文獻尤為豐富，既滿足學校重點學科建設的需要，又滿足了綜合性大學辦學需要。截止2023年底，館藏文獻總量306.75萬冊，中外文期刊8651種，珍貴古籍紙本8000余種，20000余冊。館內擁有豐富的電子文獻資源，購有中外文大型數據庫63個，并自建數據庫4個；擁有電子圖書238.75萬冊，中外文博碩士論文1280萬篇。根據專業(yè)設置和學科發(fā)展需要，圖書館及時調整文獻信息資源的收藏策略，滿足了不同類型讀者對文獻信息資源的需求。

目前圖書館已建成萬兆到館、千兆樓宇、百兆桌面、多校區(qū)光纖直連的專用網絡應用系統(tǒng)，建有符合國內一流標準的中心機房、遠程監(jiān)控室，構建了以SAN存儲、小型機、PC服務器以及ORACLE數據庫、數據遠程自動備份等為代表的功能完備的軟、硬件支撐體系。形成了由遠程包庫、本地鏡像和自建數據庫組成的、功能完善的網上信息資源服務體系，存儲設備總容量390TB，電子文獻信息存儲容量250TB，可提供24小時在線中外文期刊全文、題錄、文摘和電子圖書的查詢、瀏覽及下載等服務。應用圖星系統(tǒng)處理日常業(yè)務，文獻采訪、編目、典藏、流通、公共查詢、館際互借、期刊管理、通借通還等業(yè)務均已實現(xiàn)了自動化管理。微信平臺、移動圖書館、圖書館微官網等開通上線，為讀者提供更便捷的服務。

圖書館堅持“讀者第一，服務至上”的辦館宗旨，在利用先進的管理手段為讀者提供信息咨詢、文獻檢索、新書推薦等傳統(tǒng)服務的同時，開展網上薦購、文獻傳遞、科技查新、定題服務、數據庫應用培訓、個性化文獻推送、學科館員、區(qū)域文獻資源共享等服務項，為學校教學科研、人才培養(yǎng)、學科建設及服務地方等工作提供了有力的文獻資源保障。