東南大學數(shù)學學院辦學歷史悠久。1921年，著名數(shù)學家熊慶來先生從歐洲學成回國創(chuàng)辦了東南大學算學系。1952年院系調整后，歷經(jīng)了基礎科學系、數(shù)學力學系、應用數(shù)學系和數(shù)學系的發(fā)展，于2017年成立數(shù)學學院。歷經(jīng)百年，目前數(shù)學學院已經(jīng)形成師資力量雄厚、教學科研并重、多學科全面發(fā)展的辦學格局。

東南大學數(shù)學學科在2022年軟科中國最好學科排名中位列前 5%（全國第11 位），ESI排名全球第60位（全國第4位），在第五輪學科評估中成績優(yōu)秀。同時，支撐工程學和計算機科學ESI進入全球前萬分之一（貢獻度全校均排2）。系統(tǒng)科學學科在2024年軟科中國最好學科排名中位列全國第2位，2023年在江蘇高校優(yōu)勢學科建設工程四期項目應用轉型類學科擬立項建設學科名單中，東南大學系統(tǒng)科學成為首批20個全省著力打造的應用轉型類學科之一:“東南大學-華為校企共建應用轉型類學科”同時，系統(tǒng)科學牽頭成立“華為一東南大學”網(wǎng)絡群體智能聯(lián)合創(chuàng)新實驗室，打造AI數(shù)學理論賦能通信的高地。數(shù)學-系統(tǒng)科學學科逐漸形成了具有東大特色的前沿探索（基礎研究）- 戰(zhàn)略導向（應用基礎）齊頭并進的合作發(fā)展模式，引領學術界和行業(yè)界發(fā)展服務國家需求和社會治理。

全院共有教職工118人，其中教授32人（校首席教授3人、青年首席教授2人和青年特聘教授1人），副教授58人，講師19人；博導 46人、碩導78人。教師隊伍中有俄羅斯科學院院士1人、歐洲科學院院士1人、IEEE Fellow 1人、國家級高層次人才2人、國家級高層次青年人才8人次、科睿唯安 (Clarivate Analvtics)全球高被引科學家5人、省部級人才多人等。

學院現(xiàn)有牽頭建設的江蘇省應用數(shù)學科學研究中心、江蘇省網(wǎng)絡群體智能重點實驗室、華為-東南大學網(wǎng)絡群體智能聯(lián)合創(chuàng)新實驗室、網(wǎng)絡通信與安全紫金山實驗室數(shù)理基礎研究中心-信息數(shù)學等多個科研機構。學院擁有數(shù)學和系統(tǒng)科學2個博士后流動站與2個一級學科博士點，數(shù)學、系統(tǒng)科學和統(tǒng)計學3個一級學科碩士點，應用統(tǒng)計1個專業(yè)學位碩士點。數(shù)學與應用數(shù)學、信息與計算科學、統(tǒng)計學三個本科專業(yè)，均入選國家級一流本科專業(yè)建設點。2019年，成立顧毓琇理科試驗班。2020年，數(shù)學類專業(yè)入選教育部強基計劃。2022年，數(shù)學類專業(yè)入選江蘇省數(shù)學拔尖學生培養(yǎng)基地。

學院在基礎數(shù)學、運籌優(yōu)化、科學計算、AI大模型與數(shù)據(jù)科學、控制理論等方向的科學研究中取得了重要突破。近五年以來，學院牽頭國家重點研發(fā)計劃項目2項（新一代人工智能重大項目1項）和政府間合作項目1項、主持國家自然科學基金（重點項目2項、企業(yè)聯(lián)合重點1項、專項項目1項） 60余項，主持國家部委、華為公司、騰訊公司、國家電網(wǎng)等項目40余項，近五年科研到款近億元，發(fā)表學術論文700余篇。2022底ESI高被引論文165余篇。多項研究成果獲獎，其中包括首屆全國創(chuàng)新爭先獎1項、國際Obada獎、國家自然科學二等獎2項（參與）、省部級科學技術一等獎2項、教育部自然科學二等獎6項、國家一級學會科學技術一等獎2項。