沈陽農(nóng)業(yè)大學農(nóng)學院歷史悠久，其發(fā)展的起點為1938年創(chuàng)建的上海復旦大學農(nóng)學院農(nóng)藝系，1952年全國高等學校院系調(diào)整并入當時的沈陽農(nóng)學院，成立農(nóng)學系，設(shè)農(nóng)學專業(yè)和農(nóng)產(chǎn)品加工專業(yè)。1958年，開辦農(nóng)業(yè)氣象專業(yè)。1965年，學校進行系和專業(yè)調(diào)整，農(nóng)學系設(shè)農(nóng)學專業(yè)、土壤農(nóng)化專業(yè)、植物保護專業(yè)。1977年，恢復高考，農(nóng)學系設(shè)農(nóng)學專業(yè)、農(nóng)業(yè)氣象專業(yè)。1980年，創(chuàng)建農(nóng)業(yè)生態(tài)學教研室。1996年，經(jīng)農(nóng)業(yè)部批準，在原農(nóng)學系、園藝系、植保系的基礎(chǔ)上組建農(nóng)學院，設(shè)農(nóng)學系、蔬菜系、果樹系、植物保護系、農(nóng)業(yè)氣象系。1998年增設(shè)生態(tài)學、農(nóng)村區(qū)域發(fā)展專業(yè)。1999年，經(jīng)農(nóng)業(yè)部批準，由原農(nóng)學系和農(nóng)業(yè)氣象系合并，組建成立新的農(nóng)學院，下設(shè)農(nóng)學、應(yīng)用氣象、生態(tài)學、農(nóng)村區(qū)域發(fā)展4個本科專業(yè)和種子生產(chǎn)檢測及經(jīng)營1個?？茖I(yè)。2012年，農(nóng)學院新增大氣科學、種子科學與工程兩個本科專業(yè)。

農(nóng)學院現(xiàn)有農(nóng)學、種子科學和工程、應(yīng)用氣象學、大氣科學、生態(tài)學5個本科專業(yè)，其中農(nóng)學專業(yè)是國家特色專業(yè)、國家級一流本科專業(yè)建設(shè)點，生態(tài)學是校級示范性專業(yè)，大氣科學專業(yè)是我國東北地區(qū)唯一的氣象類本科專業(yè)。學院擁有作物學博士后流動站、作物學一級學科博士點和大氣科學、生態(tài)學一級學科碩士點。作物學下設(shè)作物栽培學與耕作學、作物遺傳育種、作物生物技術(shù)、持續(xù)發(fā)展與推廣學4個博士點。擁有作物栽培學與耕作學、作物遺傳育種、作物生物技術(shù)、持續(xù)發(fā)展與推廣學、大氣科學、遺傳學和生態(tài)學7個二級碩士點，其中作物栽培學與耕作學學科是國家級重點學科，作物遺傳育種學學科是遼寧省重點學科，作物學一級學科是遼寧省一流學科（第一層次）。學院下設(shè)作物栽培與耕作、作物遺傳育種、生態(tài)、應(yīng)用氣象、大氣科學、種子科學與工程等6個教研室；擁有水稻研究所、特種玉米研究所、花生研究所和大豆研究所4個科研實力雄厚的研究所；有國家級工程實驗室——“北方粳稻育種栽培技術(shù)國家地方聯(lián)合工程實驗室（遼寧）”；有為本科生實驗教學服務(wù)的國家級實驗教學示范中心——糧食作物生產(chǎn)實驗教學中心；有農(nóng)業(yè)農(nóng)村部重點實驗室一個--生物炭與土壤改良重點實驗室；有省部共建國家重點實驗室——北方粳稻遺傳育種重點實驗室；有省部級重點實驗室（中心）—農(nóng)業(yè)部東北水稻生物學與遺傳改良重點實驗室、農(nóng)業(yè)部東北地區(qū)作物栽培科學觀測實驗站、國家水稻區(qū)域技術(shù)創(chuàng)新中心、農(nóng)業(yè)部北方超級粳稻原原種擴繁基地、農(nóng)業(yè)部超級稻成果轉(zhuǎn)化基地、沈陽農(nóng)業(yè)大學國家水稻原原種擴繁基地；有遼寧省重大科技平臺—遼寧省生物炭工程技術(shù)中心以及遼寧省玉米育種工程技術(shù)研究分中心等。有旱田教學科研基地和水田教學科研基地510余畝，校外實驗基地900余畝，實驗教學用房10200余平方米，儀器設(shè)備3700余臺件，儀器設(shè)備總值約1.1億。

2012年以來，學院新獲批各級各類課題800余項，其中國家級課題112項，重點項目6項，省部級課題513項，其他200余項，到賬經(jīng)費4.5億元。研究成果獲國家科技進步二等獎5項，中華農(nóng)業(yè)科技獎4項，農(nóng)業(yè)部農(nóng)牧漁業(yè)豐收獎一等獎1項、二等獎2項，遼寧省科技進步一等獎9項、二等獎5項、三等獎5項。發(fā)表學術(shù)論文1200余篇（SCI收錄500余篇，EI/ISTP收錄22篇），主編著作14部，授權(quán)專利48項、軟件著作權(quán)35項，國審新品種10個、省審新品種19個。設(shè)系建院以來，為國家培養(yǎng)包括2名院士、多名國家級人才在內(nèi)的高級農(nóng)業(yè)技術(shù)人才11000人。

教職工134人，其中教授（研究員）30人，副教授（副研究員）43人；中國工程院院士1人，國家“百千萬人才工程”第一、二層次人選1人，國家級教學名師1人，國家級重大人才1人，國家級創(chuàng)新領(lǐng)軍人才2人，國家級青年人才2人，全國氣象教學名師1人，第六、七、八屆國務(wù)院學科評議組成員各1人，國家或省部級有突出貢獻專家5人；首屆種業(yè)科學家1人，全國創(chuàng)新爭先獎獲得者1人，國家現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系崗位科學家4人，全國巾幗建功標兵1人，中國科協(xié)“青年人才托舉工程”1項，研究生國家級教學成果獎二等獎1項，全國優(yōu)秀教材二等獎1項，國家現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系遼寧創(chuàng)新團隊首席專家2人，享受國務(wù)院特殊津貼11人；教育部和遼寧省學術(shù)創(chuàng)新團隊6個；全國高校黃大年式教師團隊1個；遼寧省“院士培養(yǎng)工程”人選1人，遼寧省攀登學者2人，遼寧省特聘教授5人。遼寧省教學名師3人，全國氣象教學名師1人，遼寧省“興遼英才計劃”創(chuàng)新團隊2個、中青年領(lǐng)軍人才2人、青年拔尖人才2人，遼寧省“百千萬人才工程”百人層次人選12人。生物炭研究院主辦的期刊BIOCHAR最新影響因子12.7。

現(xiàn)有本科生1111人，碩士研究生494人，博士研究生133人，博士后26人。

每年為國家培養(yǎng)的各類專業(yè)人才，畢業(yè)后分布在全國各地的農(nóng)業(yè)管理部門、科研院所、大專院校、農(nóng)業(yè)企事業(yè)單位和農(nóng)業(yè)推廣部門，從事管理、科研、教學和推廣工作。

農(nóng)學院學科體系健全、教學設(shè)備先進、師資力量雄厚，教學質(zhì)量、科技創(chuàng)新能力、學術(shù)地位全國一流。全院師生團結(jié)一致，開拓進取，繼承發(fā)揚優(yōu)良傳統(tǒng)和作風，以飽滿的熱情迎接新的發(fā)展機遇和挑戰(zhàn)。